El Juzgado fue creado por Ley N° 26.212 (B.O. 23/01/2007) y comenzó a funcionar a inicios del año 2013.
Desde la puesta en funcionamiento del Juzgado hasta el año 2015, se desempeñó como jueza la Dra. María Verónica Skanata. Luego fue designado como Juez subrogante el actual Juez de Primera Instancia Civil, Comercial, Laboral y Contencioso Administrativo de la Ciudad de Posadas, Dr. José Luis Casals (Resolución C.F.A.P. 1342/2015).
A partir del 3 de septiembre de 2019, el titular del Juzgado es el Dr. Alejandro Marcos Gallandat Luzuriaga, designado mediante concurso Nº 380 del Consejo de la Magistratura.
La nómina del personal del Juzgado, desde su creación y hasta el año 2020, fue siempre de 17 empleados/as y un Juez, no obstante que el Anexo I de la Ley N°26.212 de creación del Juzgado de Oberá preveía que debía contar con un total de 49 agentes. Esta situación pudo ser modificada recién en 2020, con la incorporación de 11 nuevos/as empleados/as y la creación de una segunda Secretaría Penal, quedando de esta manera organizado el Juzgado en 3 Secretarías: dos Secretarías Penales y una Secretaría Civil.
En el año 2021 se logró incorporar otros/as 14 agentes que fueron destinados/as a reforzar la dotación de las Secretarías existentes, además de crearse una nueva “Secretaría de Delitos Complejos” y un “Gabinete de Pericias Médicas”.
